Medisinsk statistikk

Forslag til prosjektoppgave i industriell matematikk høsten 2010 og hovedoppgave våren 2011:

Forslagsstiller og veileder: Professor Stian Lydersen, Det medisinske fakultet. e-post stian.lydersen@ntnu.no, tlf 72575428. Kontoradresse: 6 etg Kvinne Barn senteret, St Olavs hospital.

Repeterte målinger av gange hos pasienter
Beskrevet på egen side her.

Forslaget beskrevet nedenfor er ikke aktuelt lenger, den ble gjennomført av en student i 2008/2009.

Manglende data i livskvalitetsmålinger: Metodeoversikt og anvendelse på et spørreskjema for smertevurdering.

Forslag til prosjektoppgave i industriell matematikk høsten 2007 / hovedoppgave våren 2008

Forslagsstiller og veileder: Stian Lydersen, Det medisinske fakultet. e-post stian.lydersen@ntnu.no, tlf 73867270. Kontoradresse: 5. etg Kreftbygget, St Olavs hospital.
Biveiledere: Pål Klepstad og Kari Hanne Gjeilo, Det medisinske fakultet

Spørreskjemaet ”Brief Pain Inventory” (BPI)(Klepstad et al. 2002) brukes til vurdering av smerte hos pasienter i kliniske studier. BPI inneholder til sammen 15 spørsmål relatert til smerte og smertens effekt på forskjellige aspekter ved livskvaliteten. De fleste spørsmål har svaralternativer på en skala fra 0 (ikke i det hele tatt) til 10 (verst tenkelig). I Norge har BPI blant annet vært brukt i på kreftpasienter (Klepstad et al. 2002) og hjerteopererte pasienter (Gjeilo et al. 2006).

Slike datasett er sjelden komplette, dvs et eller flere spørsmål er ubesvart hos noen av pasientene. I de to nevnte studiene gjaldt dette 82 av 235 kreftpasienter, og 52 av 462 pasienter etter hjerteoperasjon. Tradisjonelt har man i slike situasjoner brukt ”complete case” analyse. Det vil si at man analyserer bare de ”case” (pasienter) der en har komplette data. I tillegg til at man mister en del av utvalget, kan man få ”bias” (forventningsskjevhet) i resultatene(Little and Rubin 2002;Schafer and Graham 2002;Fayers and Machin 2007).

Førte del av oppgaven er å beskrive kort de mest aktuelle modellene og metodene for håndtering av manglende data. Enkle metoder er å fylle ut manglende data med gjennomsnitt av andre svar, for eksempel regne ut et gjennomsnitt hvis minst 50% av spørsmålene i en gruppe av spørsmål er besvart. Jfr f.eks kapitlet ”Missing Data” i (Fayers and Machin 2007). Metodene ”maximum likelihood” og ”multippel imputasjon” (MI) regnes imidlertid for å være vesentlig bedre, nærmest ”gullstandarder” (Schafer and Graham 2002). MI går ut på å predikere (”imputere”) de manglende data og lage noen simulerte komplette datasett, analysere hvert av de komplette datasettene, og kombinere resultatene fra analysene.

Hoveddelen av oppgaven er å anvende de mest aktuelle metodene på BPI data fra studiene (Klepstad et al. 2002) og (Gjeilo et al. 2006), og sammenlikne med resultater fra ”complete case” analyse. Tilslutt skal kandidaten anbefale metode.

Det er en målsetting er at resultatene beskrives på en slik måte at de lett kan anvendes på BPI data i fremtidige studier. Det er ønskelig at dette kan inngå i en tidsskrift-publikasjon med kandidaten som medforfatter.

Nødvendig bakgrunn er emnene ”Multivariabel analyse” og ”moderne statistiske metoder”. Emnet KLMED 8003 ”Livskvalitetsmålinger” er sterkt anbefalt. ”Medisin for ikke-medisinere” er nyttig, men ikke nødvendig for oppgaven. De mest aktuelle programvarene for bruk i oppgaven er R og/eller Stata.

Reference List

Fayers PM, Machin D. Quality of life the assessment, analysis, and interpretation of patient-reported outcomes. Chichester: J. Wiley, 2007.

Gjeilo KH, Stenseth R, Wahba A, Lydersen S, Klepstad P. Validation of the Brief Pain Inventory in patients after cardiac surgery. Submitted for publication 2006.

Klepstad P, Loge JH, Borchgrevink PC, Mendoza TR, Cleeland CS, Kaasa S. The Norwegian brief pain inventory questionnaire: translation and validation in cancer pain patients. J Pain Symptom Manage 2002;24:517-525.

Little RJA, Rubin DB. Statistical analysis with missing data. Hoboken, N.J: Wiley, 2002.

Schafer JL, Graham JW. Missing data: Our view of the state of the art. Psychological Methods 2002;7:147-177.